服务概览
单细胞分析
针对已有单细胞表达数据建立从质量控制到细胞群解释的连续分析流程，明确过滤、整合和注释依据，并围绕研究分组比较细胞组成、状态和功能差异。
单细胞表达矩阵质控与标准化分析流程降维聚类、批次整合和细胞注释分析环境单细胞统计计算与交互式可视化平台
生物信息学分析
单细胞分析
Single-Cell Data Analysis
应用领域
应用领域
01 肿瘤与免疫微环境细胞组成解析
02 药物处理相关细胞状态变化研究
03 稀有细胞群和关键亚群识别
04 细胞类型标志基因与差异表达分析
05 发育、分化或状态转换轨迹探索
06 多样本单细胞数据整合与比较
技术方法
技术方法
01
数据质控与预处理
- 检查测序矩阵、样本信息、实验平台和参考版本
- 评估细胞检测基因数、分子计数、线粒体比例和环境 RNA 影响
- 识别低质量细胞和潜在双细胞，形成质控前后数据集
02
降维聚类与细胞注释
- 开展标准化、高变特征选择、降维和图聚类分析
- 评估批次效应并按实验设计整合多个样本
- 结合标志基因、参考数据和生物学背景进行细胞类型注释
03
组间比较与生物学解读
- 比较细胞比例、亚群表达和状态特征
- 筛选群体标志基因并开展功能和通路分析
- 按研究问题扩展轨迹、细胞通讯或调控网络分析
服务信息
服务信息
样品要求
- 提供 FASTQ、特征计数矩阵或兼容的单细胞数据对象
- 提供实验平台、试剂版本、物种和参考基因组信息
- 提供样本来源、分组、批次、处理条件和临床或实验元数据
- 说明预期比较、关注细胞类型及是否需要扩展分析模块
周期与质控
项目周期根据细胞数量、样本规模、数据质量和扩展分析模块评估后确认。
- 展示细胞和基因过滤依据及质控前后对比
- 检查双细胞、环境 RNA、批次效应和异常样本影响
- 记录聚类参数、注释证据和人工复核依据
- 保留分析对象、结果表、图件和可复现运行信息
交付结果
可交付结果
- 单细胞数据质控报告和标准化分析对象
- 降维分群图、细胞注释及标志基因结果
- 组间细胞组成、状态差异和功能分析结果
- 可编辑图表、结果表、分析报告与参数记录
常见问题
常见问题
单细胞分析是否包含组织解离、建库和测序？
本服务仅覆盖数据分析，不包含组织解离、细胞制备、建库或测序。项目启动时需提供可分析的数据文件和完整实验信息。
是否可以直接合并不同批次或不同平台的数据？
需要先检查数据结构、实验平台和生物分组是否可比。整合方法会根据批次来源和研究目标选择，并保留整合前后的评估结果。
细胞类型注释是否完全自动完成？
自动或参考映射结果只作为证据之一，最终注释会结合标志基因、参考数据、样本来源和研究背景进行复核，不把单一算法结果视为最终结论。