从头生成靶向线性肽 / 环肽序列
根据研究问题选择序列生成或已有序列优化入口,再衔接后续合成、验证和分析。
方案总览
把序列设计、样品制备、SPR 验证和模拟绘图安排在同一条记录链中,每一阶段的输出都进入下一步判断。
根据研究问题选择序列生成或已有序列优化入口,再衔接后续合成、验证和分析。
根据研究问题选择序列生成或已有序列优化入口,再衔接后续合成、验证和分析。
用样品质量、结合响应和动态轨迹补充候选判断,并整理为可复核图件。
服务流程
计算阶段确定进入合成的候选,合成与质控提供可检测的多肽样品,SPR 记录结合信号,模拟分析把结构和轨迹整理成科研图件。
生成候选序列,计算参数并完成排序。
阶段输出
候选序列、参数记录和合成顺序
按排序制备线性肽或环肽,记录结构和质量。
阶段输出
多肽成品、批次信息和质检记录
设置浓度梯度,记录结合与解离并完成拟合。
阶段输出
传感曲线、动力学参数和重复性记录
分析结合构象、轨迹和能量变化,整理科研图件。
阶段输出
结构图、轨迹分析和整合报告
记录关系
候选序列进入合成,成品进入结合测量,测量结果再与结构和轨迹放在一起分析。每个阶段都保留对应的原始记录。
计算设计
从靶点和锚点出发生成 1000 条线性肽或环肽序列,为每条序列计算亲和力、疏水性、等电点和能量评分,再按综合评价排出进入合成阶段的 Top 5。
CANDIDATE REGISTER
展示 100 条数据记录,前 5 条以高亮行标出。
| 候选编号 | 氨基酸序列 | 综合评分 | 疏水性 | 等电点 | 建议排序 |
|---|---|---|---|---|---|
| P-018 | ACFVKYLRGWPK | 0.284 | -0.72 | 8.63 | 01 |
| P-127 | GWLKAFCPRVMN | 0.301 | -0.58 | 7.94 | 02 |
| P-243 | RYCFLKPWAVGT | 0.317 | -0.42 | 8.21 | 03 |
| P-386 | VYRWCGKLPATF | 0.329 | -0.37 | 7.68 | 04 |
| P-412 | KLPWAFYCRVGT | 0.341 | -0.29 | 8.05 | 05 |
| P-0006 | ITAMVWWAVGTT | 0.346 | -0.28 | 6.87 | 0006 |
| P-0007 | TNAQCRNNPWDE | 0.347 | -0.28 | 6.88 | 0007 |
| P-0008 | GHALGVFDINCV | 0.348 | -0.28 | 6.90 | 0008 |
| P-0009 | RRQGDAVQDNIF | 0.348 | -0.28 | 6.91 | 0009 |
| P-0010 | ELQKHEMFVFQN | 0.349 | -0.28 | 6.92 | 0010 |
| P-0011 | PVQFMHTSPVYW | 0.350 | -0.28 | 6.93 | 0011 |
| P-0012 | RPQARLLQIMGP | 0.351 | -0.28 | 6.94 | 0012 |
| P-0013 | EIQENPDFDENY | 0.352 | -0.28 | 6.96 | 0013 |
| P-0014 | PSQYSKSSVTVH | 0.353 | -0.27 | 6.97 | 0014 |
| P-0015 | CMQSYNKHPLEA | 0.353 | -0.27 | 6.98 | 0015 |
| P-0016 | MGQWERCVIDDI | 0.354 | -0.27 | 6.99 | 0016 |
| P-0017 | PQQRAVRKDDKR | 0.355 | -0.27 | 7.00 | 0017 |
| P-0018 | CKHMFAIHVSRC | 0.356 | -0.27 | 7.02 | 0018 |
| P-0019 | MTHQKEAVPKAS | 0.357 | -0.27 | 7.03 | 0019 |
| P-0020 | YNHLPYQKICHD | 0.358 | -0.27 | 7.04 | 0020 |
| P-0021 | KHHGLDHYDRPL | 0.358 | -0.27 | 7.05 | 0021 |
| P-0022 | VRHKQGPMFIWT | 0.359 | -0.27 | 7.06 | 0022 |
| P-0023 | YLHFVKGCYAFM | 0.360 | -0.26 | 7.08 | 0023 |
| P-0024 | KFHACNWYRQEV | 0.361 | -0.26 | 7.09 | 0024 |
| P-0025 | VPHEWRNMLQLF | 0.362 | -0.26 | 7.10 | 0025 |
| P-0026 | HIHYDVFCFHSW | 0.363 | -0.26 | 7.11 | 0026 |
| P-0027 | SSYSHQVPYYCG | 0.363 | -0.26 | 7.12 | 0027 |
| P-0028 | FMYWMTMERPIP | 0.364 | -0.26 | 7.14 | 0028 |
| P-0029 | HGYRRYERLGQY | 0.365 | -0.26 | 7.15 | 0029 |
| P-0030 | SQYMNDTPFWYQ | 0.366 | -0.26 | 7.16 | 0030 |
| P-0031 | FKYQSGLEYNGA | 0.367 | -0.26 | 7.17 | 0031 |
| P-0032 | QEYLYKDRRFFI | 0.368 | -0.25 | 7.18 | 0032 |
| P-0033 | DNYGEFKGLFMR | 0.368 | -0.25 | 7.20 | 0033 |
| P-0034 | FHYKAICTFVTK | 0.369 | -0.25 | 7.21 | 0034 |
| P-0035 | QRYFFMRRYMDS | 0.370 | -0.25 | 7.22 | 0035 |
| P-0036 | DLPAKQIGREKD | 0.371 | -0.25 | 7.23 | 0036 |
| P-0037 | NFPEPTATLTRT | 0.372 | -0.25 | 7.24 | 0037 |
| P-0038 | APPYLYQIFLAE | 0.373 | -0.25 | 7.26 | 0038 |
| P-0039 | LIPSQDHWYDYM | 0.373 | -0.25 | 7.27 | 0039 |
| P-0040 | NDPWVWYLRSGV | 0.374 | -0.25 | 7.28 | 0040 |
| P-0041 | AMPRCCPILSNN | 0.375 | -0.24 | 7.29 | 0041 |
| P-0042 | LGPMWFGWFKVW | 0.376 | -0.24 | 7.30 | 0042 |
| P-0043 | WAPQDINLYCEG | 0.377 | -0.24 | 7.32 | 0043 |
| P-0044 | IKPLHMFACRLP | 0.378 | -0.24 | 7.33 | 0044 |
| P-0045 | LEGGMQVNTISH | 0.378 | -0.24 | 7.34 | 0045 |
| P-0046 | WNGKILMDNACQ | 0.379 | -0.24 | 7.35 | 0046 |
| P-0047 | IHGFNPEAHQAA | 0.380 | -0.24 | 7.36 | 0047 |
| P-0048 | TCGASSTNCHHR | 0.381 | -0.24 | 7.38 | 0048 |
| P-0049 | GLGEYWLDTHPC | 0.382 | -0.24 | 7.39 | 0049 |
| P-0050 | RFGYTCDQNYWK | 0.383 | -0.23 | 7.40 | 0050 |
| P-0051 | TYGSAFSFHPFS | 0.383 | -0.23 | 7.41 | 0051 |
| P-0052 | GIGWFIKSCGML | 0.384 | -0.23 | 7.42 | 0052 |
| P-0053 | RDGRKECQTWTT | 0.385 | -0.23 | 7.44 | 0053 |
| P-0054 | EMWMGHIFNNDE | 0.386 | -0.23 | 7.45 | 0054 |
| P-0055 | PGWQLLASHFCM | 0.387 | -0.23 | 7.46 | 0055 |
| P-0056 | CAWLQPQHCVIF | 0.387 | -0.23 | 7.47 | 0056 |
| P-0057 | EKWGVSHVTVQN | 0.388 | -0.23 | 7.48 | 0057 |
| P-0058 | PEWKCWYKNMYW | 0.389 | -0.23 | 7.50 | 0058 |
| P-0059 | CWWFWRPHHEGP | 0.390 | -0.23 | 7.51 | 0059 |
| P-0060 | MHWADVGVCTNY | 0.391 | -0.22 | 7.52 | 0060 |
| P-0061 | YCWEHAWKTLVH | 0.392 | -0.22 | 7.53 | 0061 |
| P-0062 | CLWYMENYNDEQ | 0.392 | -0.22 | 7.54 | 0062 |
| P-0063 | MFNSIHFMHSDI | 0.393 | -0.22 | 7.56 | 0063 |
| P-0064 | YYNWNLVCCKKR | 0.394 | -0.22 | 7.57 | 0064 |
| P-0065 | KINRSPEYTKRC | 0.395 | -0.22 | 7.58 | 0065 |
| P-0066 | VDNMYKTMWCAK | 0.396 | -0.22 | 7.59 | 0066 |
| P-0067 | HVNQTNLCQRHD | 0.397 | -0.22 | 7.60 | 0067 |
| P-0068 | KGNLARDPKIPL | 0.397 | -0.22 | 7.62 | 0068 |
| P-0069 | VANGFVSEEAWT | 0.398 | -0.21 | 7.63 | 0069 |
| P-0070 | HKNKKAKCWQVM | 0.399 | -0.21 | 7.64 | 0070 |
| P-0071 | SENFGECPQHEV | 0.400 | -0.21 | 7.65 | 0071 |
| P-0072 | FWFALYREKYLF | 0.401 | -0.21 | 7.66 | 0072 |
| P-0073 | QHFEQDIREYSN | 0.402 | -0.21 | 7.68 | 0073 |
| P-0074 | SCFYVGAGWPCG | 0.402 | -0.21 | 7.69 | 0074 |
| P-0075 | FTFSRKHTQGIP | 0.403 | -0.21 | 7.70 | 0075 |
| P-0076 | QFFWWNYRKWQY | 0.404 | -0.21 | 7.71 | 0076 |
| P-0077 | DYFRDRPGENYH | 0.405 | -0.21 | 7.72 | 0077 |
| P-0078 | NIFMHVGTWFWA | 0.406 | -0.20 | 7.74 | 0078 |
| P-0079 | QDFQEQWIQVFI | 0.407 | -0.20 | 7.75 | 0079 |
| P-0080 | DVFLITNWKMMR | 0.407 | -0.20 | 7.76 | 0080 |
| P-0081 | NGVGNYFLEMTK | 0.408 | -0.20 | 7.77 | 0081 |
| P-0082 | AAVKSDVIWEDS | 0.409 | -0.20 | 7.78 | 0082 |
| P-0083 | LSVFPGMWQTKD | 0.410 | -0.20 | 7.80 | 0083 |
| P-0084 | WEVATKELKLRL | 0.411 | -0.20 | 7.81 | 0084 |
| P-0085 | AWVEAFTAEDAE | 0.412 | -0.20 | 7.82 | 0085 |
| P-0086 | LQVYFIDNWSYM | 0.412 | -0.20 | 7.83 | 0086 |
| P-0087 | WCVSKMSDAKGV | 0.413 | -0.19 | 7.84 | 0087 |
| P-0088 | ITVWGQKASCNF | 0.414 | -0.19 | 7.86 | 0088 |
| P-0089 | TFVRLTCNMCVW | 0.415 | -0.19 | 7.87 | 0089 |
| P-0090 | WYMMQYRDGREG | 0.416 | -0.19 | 7.88 | 0090 |
| P-0091 | IRMQVDIQAILP | 0.417 | -0.19 | 7.89 | 0091 |
| P-0092 | TDMLRWAFSASH | 0.417 | -0.19 | 7.90 | 0092 |
| P-0093 | GVMGWCQSMQCQ | 0.418 | -0.19 | 7.92 | 0093 |
| P-0094 | RPMKDFHQGHAA | 0.419 | -0.19 | 7.93 | 0094 |
| P-0095 | EAMFHIYFAYHI | 0.420 | -0.19 | 7.94 | 0095 |
| P-0096 | GSMAEMPSSPPC | 0.421 | -0.18 | 7.95 | 0096 |
| P-0097 | REMEIQWHMPWK | 0.422 | -0.18 | 7.96 | 0097 |
| P-0098 | EWMYNLNVGGFS | 0.422 | -0.18 | 7.98 | 0098 |
| P-0099 | PQESSPFKAWMD | 0.423 | -0.18 | 7.99 | 0099 |
| P-0100 | CCEWPSVHSNTT | 0.424 | -0.18 | 8.00 | 0100 |
结构前提、参数记录和候选顺序放在同一份记录中。
合成质控
选择排序前 5 名序列进行合成,环肽采用首尾环化。每条成品规格为 5 mg、纯度 >90%。如果某条环化失败,按排序依次补做,直到完成 5 个环肽。
DELIVERY RECORD
选择排序前 5 名序列,环肽采用首尾环化。
交付 5 条优势多肽成品,5 mg / 条。
记录批号、外观、储存条件和保质期。
保留 HPLC、质谱及纯度结果,标准 >90%。
实验验证
针对 5 条合成多肽设置多浓度梯度,记录结合与解离阶段的响应信号,通过模型拟合计算亲和力和结合、解离速率,并完成 3 次重复实验。
ka
结合速率
kd
解离速率
KD
平衡亲和力
结果阅读
亲和力参数需要和响应曲线、对照体系、拟合质量及重复性记录一起阅读。
模拟分析
把结合构象、残基接触、模拟体系和自由能变化放在同一份分析记录中,整理出可用于科研沟通的结构结论和图件。
ANALYSIS LOG
每一段都对应一类图件和可复核的数值记录。
从结合构象和关键残基接触开始,确认后续模拟要观察的区域。
查看复合物构象、局部波动、相互作用和能量随时间的变化。
把结构、轨迹和能量结果排成便于科研沟通的图件。
成果交付
交付目录把序列、样品、实验数据、模拟结果和科研图件放在同一条项目记录中。
序列与排序
交付 1000 条线性肽或环肽序列,附亲和力、疏水性、等电点和能量评分,并列出 Top 5 优先级。
样品与质控
提供 5 条优势多肽成品、批号、外观、储存条件、保质期、HPLC、质谱和纯度记录。
实验数据
保留多浓度响应曲线、结合与解离信号、拟合结果和 3 次重复实验记录。
结构与模拟
整理三维结合模式、关键残基、RMSD、RMSF、氢键、自由能和稳定性分析。
科研表达
汇总候选序列、突变位点、样品信息、实验结果、模拟分析和科研绘图材料。
文件组织:序列、样品、原始数据和分析图件按阶段编号,方便查找和继续实验。
相关技术服务
了解单项服务的适用场景、样品要求和质量控制。
项目咨询
提供靶点信息、已有序列或抗原材料后,可以确认候选生成、样品制备、结合验证和模拟分析的安排。
咨询时可一并说明目标分子、已有数据和计划使用的验证方式。
咨询多肽项目方案