仅做计算筛选
筛选可以较快缩小范围，但真实结合和特异性仍需实验判断。
方案总览
计算结果与实验数据相互校验
虚拟筛选负责缩小范围，动态模拟查看候选随时间的表现，SPR 测量结合和解离。三种方法依次衔接后，候选推进和调整的依据会更加清楚。
仅做实验验证
实验结果直接，但没有前置收敛时，样品投入和验证顺序难以聚焦。
仅看静态构象
静态构象可以提出结合模式，无法单独说明构象波动、接触维持和体系稳定性。
连续证据链
候选范围、动态机制与实验证据
- 01
先缩小候选范围
从靶点结构、作用位点和化合物信息开始，先整理需要重点关注的候选，再进入精细分析。
- 02
观察动态互作
把一次性的结合构象放回连续轨迹，复核构象变化、关键接触和能量表现，为候选排序补上机制依据。
- 03
用实验信号复核
用实时结合和解离信号检验计算判断，同时保留原始传感数据、拟合过程和质量复核记录。
三阶段服务流程
上一阶段的输出进入下一阶段
结构、参数、原始数据和判断依据沿流程保留，便于复核候选去留并安排后续工作。
- 01 / A
高通量虚拟筛选
整理结构、分层筛选，并给出候选优先级
筛选后 · 推进依据
动态分析的候选推进依据
结构条件、评价维度、聚类代表性和类药性信息共同决定推进顺序。
- 02 / B
分子动力学模拟
在轨迹中查看稳定性和作用机制
模拟后 · 推进依据
结合模式的轨迹稳定性
结合构象、关键残基接触、相互作用维持和能量趋势需要放在同一轨迹中查看。
- 03 / C
SPR 实验验证
用实时结合信号复核候选，形成实验依据
实验后 · 推进依据
真实结合信号的判定依据
参比处理、拟合参数、残差、重复性和特异性观察共同决定结果的解释方式。
候选收敛
高通量虚拟筛选
从靶点结构和研究问题开始，统一化合物与筛选条件，再按层级评价逐步缩小范围，形成便于采购、复核和实验安排的候选顺序。
四步收敛路径
- 1
结构准备
检查靶点结构质量、作用位点和筛选边界
- 2
化合物标准化
统一结构表示，清理重复与异常条目
- 3
分层筛选
经过快速过滤、对接评价和精细复核
- 4
候选整理
结合聚类、多样性和类药性信息安排优先级
阶段输出：结构准备材料、筛选条件记录、候选评价信息、聚类结果和动态分析优先级。
筛选质量控制
结构前提、数据处理和候选代表性需要同时记录。
- 结构与口袋 Q1
- 检查结构质量、作用位点和筛选边界，明确候选评价所依赖的结构前提。
- 数据标准化 Q2
- 统一化合物结构表示，处理重复、异常和不适宜条目，保留排序过程的追溯线索。
- 候选多样性 Q3
- 结合聚类和类药性信息保留有代表性的候选，避免优先级集中在同一类骨架。
动态机理
分子动力学模拟
在设定的体系、溶剂和边界条件下观察复合物的动态变化，比较构象稳定性、关键接触维持和能量表现，为实验顺序提供机制依据。
动态分析流程
把静态构象放回连续轨迹
先完成体系构建和平衡检查，再分析复合物的动态表现并解释候选差异。
- 1
体系构建
根据复合物结构准备蛋白、配体、溶剂和离子环境，记录使用的参数与边界条件。
- 2
平衡与轨迹
先检查体系的平衡状态，再查看轨迹中的整体构象、局部柔性和相互作用。
- 3
机制复核
把氢键、疏水作用、关键残基和能量变化放在一起比较，解释候选之间的动态差异。
实验确认
SPR 结合动力学验证
为优先候选设置对照和浓度梯度，实时记录结合与解离过程，再结合参比处理、模型拟合和重复性评价判断结合信号。
实验与质量检查
- C1
实验设计
按分子性质和预期结合范围设置固定、进样与再生策略
- C2
对照体系
设置参考通道、空白及适用的阴性或阳性对照
- C3
动力学拟合
将实测曲线与模型拟合结果对照，报告 ka、kd 和 KD
- C4
质量复核
通过残差、重复性和原始传感图复核结果
结果阅读
同时看响应、参数和质量
亲和力参数需要和响应曲线、对照体系、拟合质量及重复性记录一起阅读。
- R1实时响应
- SPR 无需标记即可记录结合与解离过程，帮助区分瞬时响应和可解释的动力学行为。
- R2参数关系
- 结合速率 ka、解离速率 kd 和平衡亲和力 KD 需要结合曲线形状与拟合模型阅读。
- R3结果可信度
- 空白、参比、重复进样、非特异性结合和拟合残差都要纳入质量判断。
成果交付
技术档案与数据目录
交付物按照复核、衔接和科研沟通的需要编排，覆盖结构、筛选、动态分析、实验数据和整合报告。
- 01
结构与筛选
靶点结构与口袋材料
整理靶蛋白三维结构、结构模型、活性口袋定位、作用位点和筛选边界，保留后续复核依据。
- 02
结构与筛选
筛选结果与候选排序
提供候选基础信息、对接评价、结合能记录、多层筛选过程、聚类结果和优先级建议。
- 03
动态分析
动态轨迹与分析结果
交付动态轨迹、构象演化、体系能量变化、RMSD/RMSF、氢键、疏水作用和界面稳定性分析材料。
- 04
实验数据
SPR 原始与拟合数据
保留实时传感图、结合与解离原始信号、参比处理、模型拟合参数和质量评价信息。
- 05
科研表达
科研沟通图件
输出蛋白与小分子的结合模式、活性口袋、关键残基、动态指标和筛选排名对比图件。
- 06
科研表达
整合报告与数据表
汇总研究思路、筛选逻辑、分析过程、核心结论、候选决策依据和可编辑数据表。
交付组织：文件、分析深度和实验组合按研究问题、样品条件与各阶段结果编排。
相关技术服务
查看单项服务内容
可查看单项服务的适用场景、样品要求、质量控制和常见交付。
项目咨询
先从研究问题确认验证路径
提供靶点信息、已有结构或候选分子背景后，可以进一步确认筛选策略、动态分析重点、实验可行性和阶段交付节点。
方案根据输入质量和阶段结果确定候选优先级与后续验证安排。
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